Od 1998 roku UKFiS włączył rozgrywki o Mistrzostwo Polski do lat 15-tu do programu Ogólnopolskiej Olimpiady Młodzieży i zmienił system rozgrywek, zrównując je z rozgrywkami chłopców. Tym samym po raz pierwszy UKFiS włączył rozgrywki dziewcząt - juniorek młodszych do ogólnopolskiego systemu współzawodnictwa dzieci i młodzieży, co w niezwykle korzystny sposób wpłynęło na popularyzację tej dyscypliny sportu. Dla przykładu: w 1998 roku w tych zawodach wzięły udział 252 zespoły.

Od 2000 roku rozpoczęto w Polsce rozgrywki w kategorii juniorek (najpierw U-18, potem U-19). W I mistrzostwach wystartowało 15 drużyn podzielonych na grupy eliminacyjne. Osiem najlepszych zagrało w Koninie na stadionie miejskim im. Złotej 11 K. Górskiego w dniach 18-20 października 2000r. w turnieju finałowym. Gospodynie nie zawiodły, pokonując w meczu o 3 miejsce swojego odwiecznego rywala - drużynę "Czarnych" Sosnowiec 4:0. W II Mistrzostwach Polski Juniorek wystartowały 24 drużyny. W turnieju finałowym koninianki powtórzyły sukces z I Mistrzostw Polski zdobywając 2.09.2001 brązowy medal w następującym składzie: 

W 2002 roku "MEDYK" dotarł aż do finału, gdzie uległ Czarnym Sosnowiec 0:1 zdobywając tym samym srebrny medal. Po przejściu trenera Romana Jaszczaka we wrześniu 1995 roku do pracy w Zespole Szkół Górniczo - Energetycznych w Koninie, najmłodsze piłkarki "Medyka" zaczęły coraz częściej wybierać sobie jako miejsce dalszej edukacji właśnie tę szkołę. Na początku nie było łatwo przekonać nowe środowisko do piłki nożnej dziewcząt. Kiedy jednak zarówno trener, jaki zawodniczki zadomowiły się w tej szkole na dobre zaczęto czynić starania, aby na bazie ZSG-Ew klasach Liceum Profilowanego utworzyć klasy sportowe. Dzięki przychylności Urzędu Miejskiego w Koninie i dyrektora szkoły Karola Dunaja 1.09.2002 roku powstała pierwsza klasa o rozszerzonymo piłkę nożną programie wychowania fizycznego.

Od tego momentu rozpoczęło się pasmo sukcesów dziewcząt w tej kategorii wiekowej, które w 10 lat wywalczyły  10 medali. A od 2003 roku osiem tytułów  Mistrzyń Kraju z rzędu dla siebie, szkoły, klubu i Konina.

 

Tytuł Mistrzyń Polski Juniorek w 2005 "Medyka" wywalczyły w następującym składzie: Katarzyna Jankowska, Patrycja Majchrzak, Kaja Ożgo, Paulina Czerniejewska, Kamila Darda, Weronika Szczeblewska, Joanna Płonowska, Anna Pioruńska, Łucja Karczmarz, Magdalena Krępic, Agata Stencelewicz, Kinga Kwitowska, Karolina Dudek, Nina Patalon, Karolina Wolska, Katarzyna Sołtysińska, Marta Woźniak, Anna Kałużna, Natalia Czernielewska, Anna Błażejewska, Katarzyna Rusek, Katarzyna Pioruńska, Ewelina Pytel.